Göynük ilçesinin  tarihi Roma, Bizans ve Anadolu tarihi ile iç içedir. Roma Askeri yolunun Dadastan adı ile bilinen ve şimdiki adıyla GÖYNÜK olan ilçemizden geçtiği tarih kitaplarında ifade edilmektedir. Göynük'ün bilinen en eski adı Koinon Gallicanon'dur. İlçenin Susuz, Kilciler, Narzanlar, Boyacılar köylerinde ve bu köylerin civarlarında bizans devrine ait yazı taşları bulunmaktadır. Ayrıca Kilciler köyünde birde kilise kalıntısı bulunmaktadır.

İstanbul'un ikinci defa kuşatılmasından sonra Bizans imparatoru Yuannis ile anlaşan Yıldırım Beyazıt, Göynük dolaylarından bir kısım ahaliyi İstanbul'da kurulacak İslam mahallesi için İstanbul'a yerleştirmiştir. Ancak yapılan anlaşma bozulunca Göynüklüler İstanbul'dan ayrılarak Tekirdağ'da Göynüklü köyünü kurmuşlardır.

1453 yılında İstanbul'un fethinde, Fatih Sultan Mehmet'in   hocası Akşemseddin Hz'leri olup fetihte büyük katkısının olduğu da tarihe geçmiştir. Bu Büyük Veli Akşemseddin Hz'leri Eyüp Sultan Hz'nin kabrini bulmuş ve Pastörden asırlarca önce mikrobu keşfetmiştir. Fetihten sonra devlet İşlerinden elini çeken Akşemseddin Hz'leri Göynük'e yerleşerek 15 yıl burada yaşamış ve Göynük'te vefat etmiştir. Bu büyük zatın türbesi ilçemizdedir. .Bununla birlikte büyük velilerden Debbağ Dede Hazretleri ve Ömer Sikkin Hz'nin türbeleri de Göynük'te bulunmaktadır.

Cumhuriyet döneminde idari teşkilat yeniden kurulduğundan, Bolu vilayet olmuştur. Göynük, Düzce,Gerede ve Mudurnu Bolu'nun ilk kazalarını oluşturmuşlardır. Halen Göynük Bolu'ya bağlı bir İlçedir. 1923'de ilçenin İlk Kaymakamı Hurşit Bey olup bu dönemde Kurtuluş Zaferi anısına ilçenin hakim tepesine Zafer Kulesi inşa edilmiştir. Halen bu kule tarihi anıtsal yapı olarak korunmaktadır. Her yıl Mayıs ayının son Pazar günü İlçede Akşemseddin'i anma şenlikleri yemekli olarak yapılmaktadır.

Göynük; kültürü, tarihi, tabiatı, maneviyatı ve gezilip görülmeye değer birçok zenginlikleri ile tarihi atmosferinde sizleri yaşatabilecek ender bir Anadolu şehridir.